精品无码久久久久久久动漫,国产亚洲精品久久久999蜜臀,免费无码成人AV电影在线播放,白嫩少妇激情无码

您好,歡迎進入研域(上海)化學試劑有限公司網(wǎng)站!
一鍵分享網(wǎng)站到:
  • 公司動態(tài)NEWS

    您當前的位置:首頁 > 公司動態(tài) > 利用Ion半導體測序開展基因表達譜分析

    利用Ion半導體測序開展基因表達譜分析

    發(fā)布時間: 2012-11-05  點擊次數(shù): 2648次

                 研究顯示雜交芯片可產(chǎn)生大約兩百萬個已定位的讀取[7],但也有研究證實,即使讀取數(shù)目過億,提高讀取數(shù)目仍然繼續(xù)增加其信息量 那么,究竟Ion PGM™測序儀生成多少個100 base讀取能相當于一個基因表達微陣列芯片呢?在白皮書[9]中我們對Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Arrays (HG-U133 Plus 2.0)的芯片質(zhì)量控制(MAQC)的微陣列數(shù)據(jù)與Ion PGM™系統(tǒng)生成的RNA-Seq數(shù)據(jù)進行了比較。圖1顯示了Ion PGM™測序儀數(shù)據(jù)按照不同檢測閾值下所得的基因數(shù)和微陣列芯片所能檢測到的基因數(shù)。當采用zui嚴謹?shù)臋z測閾值即每個基因≥10讀取時,兩百萬個來自Ion PGM™測序儀的已定位讀取所能檢測到的基因數(shù)超過了微陣列芯片能檢測的基因。

                 當讀取計數(shù)閾值放寬到≥5讀段數(shù)/基因時,僅僅1百萬個Ion RNA-Seq已定位讀取所能檢測到的基因數(shù)就超過了芯片的基因檢測數(shù)。利用來自Ion PGM™測序儀的2百萬個平均讀取所能檢測到的顯著差異表達基因數(shù)(sig DEGs)要多于微陣列芯片所能檢測到的sig DEGs數(shù)。在p ≤0.05和倍數(shù)變化f≥2標準下,在HBRR和UHRR樣本中Ion PGM™測序儀得到的sig DEGs數(shù)為4,630,而相比之下芯片得到的sig DEGs數(shù)為4,198將Ion PGM™測序儀生成的兩百萬個已定位讀取所產(chǎn)生的基因差異表達結(jié)果與qPCR結(jié)果相比較,發(fā)現(xiàn)qPCR 和RNA-Seq得到的sigDEGs倍數(shù)變化的對數(shù)值的Pearson相關系數(shù)(R)超過0.95。

                 在Ion PGM™平臺進行RNA-Seq實驗的另一個優(yōu)勢在于,能夠應用ERCC RNA Spike-In Mix對轉(zhuǎn)錄本檢測靈敏度進行評估。這些ERCC轉(zhuǎn)錄本混合物是一些含多聚腺苷酸化且無標記的RNA,該混合物經(jīng)過美國國家標準技術研究所(NIST)鑒定,是評估RNA測量系統(tǒng)性能的工具,能控制實驗可變因素。這些ERCC轉(zhuǎn)錄本的GC含量經(jīng)過平衡,更貼近真核生物內(nèi)源性mRNA的特征,它們的長度范圍在250 到2,000個核苷酸之間。ERCC轉(zhuǎn)錄本混合物的含量構(gòu)成經(jīng)特殊設計,能代表一個大動態(tài)范圍的表達水平。ERCC ExFold RNA Spike-In Mix可用于評估基因差異表達的檢測靈敏度。這些質(zhì)控RNA使用戶得以直接評估文庫質(zhì)量、檢測靈敏度、動態(tài)范圍以及表達倍數(shù)變化。劑量響應散點圖顯示,ERCC相對濃度的對數(shù)值與已定位讀取數(shù)的對數(shù)值呈線性關系(圖2)。利用這些外部RNA質(zhì)控有助于將來自合作實驗室所產(chǎn)生的結(jié)果進行直接比較。

產(chǎn)品中心 Products
在線客服 聯(lián)系方式

服務熱線

021-54479081
021-54461587

日韩精品久久久肉伦网站| 久久精品国产亚洲77777 | 国产精品9999久久久久仙踪林| 老汉精品免费av在线播放 | 亚洲色噜噜狠狠站欲八| 亚洲av乱码一区二区三区| 99久久国产精品免费一区二区| 久久久久亚洲av成人网| 国产精品久久一区二区三区| 极品少妇被猛得白浆直流草莓视频| 国产乱人对白a片麻豆| 精品无码av无码免费专区| 7777色鬼xxxx欧美色妇| 日本熟妇50岁hd| 浪荡人妻共32部黑人大凶器电影| 亚洲精品一区二区三区中文字幕| 蜜臀av午夜一区二区三区| 成人免费a级毛片无码片2022| 亚洲阿v天堂在线| 亚洲av无码乱码国产精品久久| 精品国精品国产自在久国产应用| 西瓜在线看免费观看视频| 久久久久免费看黄a片app| 亚洲电影在线观看| 日本一区二区三区视频| 中文字幕无码无码专区| 无码人妻精品中文字幕| 无码av天堂一区二区三区| 最近中文字幕高清免费MV| 一本一道久久a久久精品综合| 欧美老妇交乱视频在线观看| 自己在线观看免费高清| 亚洲AV无码专区国产乱码电影| 中文字幕精品无码亚洲字| fba欧美专线| 亚洲av本道一区二区三区四区| 国产亚洲精品无码成人| 99国产欧美精品久久久蜜芽| 吃奶呻吟打开双腿做受视频| 四虎AV永久在线精品免费观看| 成人国内精品久久久久影院|