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    Nature子刊:三項研究闡述調控基因轉錄的機制

    發(fā)布時間: 2012-08-16  點擊次數(shù): 1880次

    如今,來自美國西北大學物理科學腫瘤學中心(Physical Sciences-Oncology Center, PS-OC)的研究人員的三項開創(chuàng)性研究報道了他們在方法上取得的重要進步,這將使得人們更好地理解在正常細胞和癌細胞中,基因表達是如何受到調控的,同時也可能導致人們開發(fā)出更加有效的治療試劑來治療癌癥病人。這三篇論文zui近分別在Nature Genetics、Nature Biotechnology和Nature期刊上,可能有助于揭示控制基因轉錄的機制。

    DNA*密碼就是DNA遺傳密碼,能夠確定細胞蛋白的組成。2006年前,Widom和Segal就已在這篇論文中報道,他們發(fā)現(xiàn)第二種DNA密碼能夠解釋DNA環(huán)繞著組蛋白復合物形成的線軸樣結構--核小體--的布局。

    根據(jù)2012年5月27日在線發(fā)表在Nature Genetics期刊上的一篇論文和2012年5月20日在線發(fā)表在Nature Biotechnology期刊上的另一篇論文,Segal研究小組開發(fā)出出一種優(yōu)雅的實驗系統(tǒng):它能夠允許他們準確地測量不利于核小體形成的DNA序列對轉錄調節(jié)的影響。這項新研究使得他們能夠以一種規(guī)劃好的和系統(tǒng)性的方式,同時導入上萬個DNA序列區(qū)域到上萬個活細胞之中---每個細胞導入一個DNA區(qū)域---,而且能夠在一次實驗中非常地和測量每個這樣的變化產(chǎn)生的結果。利用這種系統(tǒng),Segal研究小組證實促進核小體形成的DNA序列確實對轉錄產(chǎn)生顯著性負面的影響。見:“Manipulating nucleosome disfavoring sequences allows fine-tune regulation of gene expression in yeast” 和“Inferring gene regulatory logic from high-throughput measurements of thousands of systematically designed promoters”。

    根據(jù)第三篇于2012年6月3日在線發(fā)表在Nature期刊上的論文,研究人員描述了另一種方法上的主要進步。這種新技術允許他們比以前更加高地繪制核小體在基因組上的位置。這種技術不僅可以讓人們更好地理解轉錄調控,同時它也應當有助于科學家們理解DNA生物學的基因特征。“A map of nucleosome positions in yeast at base-pair resolution”

    根據(jù)2006年發(fā)表在Nature期刊上一篇論文,通信作者 Jonathan Widom和Eran Segal 描述了一種繪制核小體的新方法。越來越清楚的是,在人體內,負責DNA組裝成染色質的細胞裝置發(fā)生突變是腫瘤產(chǎn)生的主要推動力。染色質是由DNA和蛋白組成的復合物,當遭受壓縮時會形成染色體。這項研究允許人們闡述在細胞中染色質組裝機制,從而有助于理解在癌癥中是什么發(fā)生偏差和如何修復這種偏差。

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